Exécution de commandes Bash en Python

Question

Sur ma machine locale, j'exécute un python script qui contient cette ligne

bashCommand = "cwm --rdf test.rdf --ntriples > test.nt"
os.system(bashCommand)

Cela fonctionne bien.

J'exécute ensuite le même code sur un serveur et j'obtiens le message d'erreur suivant

'import site' failed; use -v for traceback
Traceback (most recent call last):
File "/usr/bin/cwm", line 48, in <module>
from swap import  diag
ImportError: No module named swap

Donc ce que j'ai fait ensuite, c'est que j'ai inséré un print bashCommand qui m'imprime que la commande dans le terminal avant de l'exécuter avec os.system() .

Bien sûr, je reçois à nouveau l'erreur (causée par os.system(bashCommand) ) mais avant cette erreur, il imprime la commande dans le terminal. Ensuite, j'ai simplement copié cette sortie et fait un copier-coller dans le terminal, puis j'ai appuyé sur Entrée et ça marche...

Est-ce que quelqu'un a une idée de ce qui se passe ?

Answer 1

Vous pouvez également utiliser 'os.popen'. Exemple :

import os

command = os.popen('ls -al')
print(command.read())
print(command.close())

Sortie :

total 16
drwxr-xr-x 2 root root 4096 ago 13 21:53 .
drwxr-xr-x 4 root root 4096 ago 13 01:50 ..
-rw-r--r-- 1 root root 1278 ago 13 21:12 bot.py
-rw-r--r-- 1 root root   77 ago 13 21:53 test.py

None

Answer 2

Selon l'erreur, il vous manque un paquet nommé swap sur le serveur. Ce site /usr/bin/cwm l'exige. Si vous êtes sur Ubuntu/Debian, installez python-swap en utilisant l'aptitude.

Answer 3

Pour exécuter la commande sans shell, passez la commande en tant que liste et implémenter la redirection en Python en utilisant [subprocess] :

#!/usr/bin/env python
import subprocess

with open('test.nt', 'wb', 0) as file:
    subprocess.check_call("cwm --rdf test.rdf --ntriples".split(),
                          stdout=file)

Note : pas de > test.nt à la fin. stdout=file met en œuvre la redirection.

---

Pour exécuter la commande à l'aide de l'interpréteur de commandes en Python, passez la commande en tant qu'objet chaîne de caractères et permettre shell=True :

#!/usr/bin/env python
import subprocess

subprocess.check_call("cwm --rdf test.rdf --ntriples > test.nt",
                      shell=True)

Voici le shell responsable de la redirection de la sortie ( > test.nt est dans la commande).

---

Pour lancer une commande bash qui utilise des bashismes, spécifiez explicitement l'exécutable bash ; par exemple, pour émuler la substitution du processus bash :

#!/usr/bin/env python
import subprocess

subprocess.check_call('program <(command) <(another-command)',
                      shell=True, executable='/bin/bash')

Answer 4

La façon pythonique de faire cela est d'utiliser subprocess.Popen

subprocess.Popen prend une liste dont le premier élément est la commande à exécuter, suivie de tout argument de ligne de commande.

A titre d'exemple :

import subprocess

args = ['echo', 'Hello!']
subprocess.Popen(args) // same as running `echo Hello!` on cmd line

args2 = ['echo', '-v', '"Hello Again"']
subprocess.Popen(args2) // same as running 'echo -v "Hello Again!"` on cmd line

Answer 5

subprocess.Popen() est préférée à os.system() car il offre plus de contrôle et de visibilité. Cependant, si vous trouvez subprocess.Popen() trop verbeux ou trop complexe, peasyshell est un petit wrapper que j'ai écrit au-dessus, qui permet d'interagir facilement avec bash depuis Python.

https://github.com/davidohana/peasyshell