J'ai un fichier CSV (24.1 MB) que je ne peux pas lire entièrement dans ma session R. Lorsque j'ouvre le fichier dans un tableur, je peux voir 112 544 lignes. Lorsque je le lis dans R avec read.csv Je n'obtiens que 56 952 lignes et cet avertissement :
cit <- read.csv("citations.CSV", row.names = NULL,
comment.char = "", header = TRUE,
stringsAsFactors = FALSE,
colClasses= "character", encoding= "utf-8")
Warning message:
In scan(file, what, nmax, sep, dec, quote, skip, nlines, na.strings, :
EOF within quoted stringJe peux lire le fichier entier dans R avec readLines :
rl <- readLines(file("citations.CSV", encoding = "utf-8"))
length(rl)
[1] 112545Mais je n'arrive pas à le récupérer dans R comme une table (via read.csv ):
write.table(rl, "rl.txt", quote = FALSE, row.names = FALSE)
rl_in <- read.csv("rl.txt", skip = 1, row.names = NULL)
Warning message:
In scan(file, what, nmax, sep, dec, quote, skip, nlines, na.strings, :
EOF within quoted stringComment puis-je résoudre ou contourner ce message EOF (qui semble être plus une erreur qu'un avertissement) afin d'obtenir le fichier entier dans mon système d'exploitation ? R session ?
J'ai des problèmes similaires avec d'autres méthodes de lecture de fichiers CSV :
require(sqldf)
cit_sql <- read.csv.sql("citations.CSV", sql = "select * from file")
require(data.table)
cit_dt <- fread("citations.CSV")
require(ff)
cit_ff <- read.csv.ffdf(file="citations.CSV")Voici mon sessionInfo()
R version 3.0.1 (2013-05-16)
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
locale:
[1] LC_COLLATE=English_United States.1252 LC_CTYPE=English_United States.1252
[3] LC_MONETARY=English_United States.1252 LC_NUMERIC=C
[5] LC_TIME=English_United States.1252
attached base packages:
[1] tools tcltk stats graphics grDevices utils datasets methods base
other attached packages:
[1] ff_2.2-11 bit_1.1-10 data.table_1.8.8 sqldf_0.4-6.4
[5] RSQLite.extfuns_0.0.1 RSQLite_0.11.4 chron_2.3-43 gsubfn_0.6-5
[9] proto_0.3-10 DBI_0.2-7
