Erreur dans plot.new() : marges de la figure trop grandes en R

Question

Je suis novice en R mais j'ai déjà réalisé de nombreux graphiques de corrélation avec des ensembles de données plus petits. Cependant, lorsque j'essaie de tracer un grand ensemble de données (2 Go et plus), je peux produire le tracé sans problème, mais la légende ne s'affiche pas. Des conseils ? ou des alternatives ?

library(gplots)
r.cor <- cor(r)
layout(matrix(c(1,1,1,1,1,1,1,1,2,2), 5, 2, byrow = TRUE))
par(oma=c(5,7,1,1))
cx <- rev(colorpanel(25,"yellow","black","blue"))
leg <- seq(min(r.cor,na.rm=T),max(r.cor,na.rm=T),length=10)
image(r.cor,main="Correlation plot Normal/Tumor data",axes=F,col=cx)
axis(1, at=seq(0,1,length=ncol(r.cor)), labels=dimnames(r.cor)[[2]], 
    cex.axis=0.9,las=2)
axis(2,at=seq(0,1,length=ncol(r.cor)), labels=dimnames(r.cor)[[2]],
     cex.axis=0.9,las=2)
image(as.matrix(leg),col=cx,axes=T)     

Erreur dans plot.new() : marges des chiffres trop importantes

tmp <- round(leg,2)
axis(1,at=seq(0,1,length=length(leg)), labels=tmp,cex.axis=1)

Answer 1

Vérifiez si votre objet est une liste ou un vecteur. Pour ce faire, tapez is.list(yourobject) . Si c'est le cas, essayez de le renommer x<-unlist(yourobject) . Cela le transformera en un vecteur que vous pourrez tracer.

Answer 2

Zoomez sur cette zone si vous utilisez RStudio.

Answer 3

J'ai trouvé cette erreur aujourd'hui. Initialement, j'essayais de le sortir dans un fichier .jpeg fichier de faible largeur et hauteur.

jpeg("method1_test.jpg", width=900, height=900, res=40)

Plus tard, j'ai augmenté la largeur et la hauteur à :

jpeg("method1_test.jpg", width=1900, height=1900, res=40)

L'erreur n'était pas là. :)

Vous pouvez également jouer avec la résolution, si la résolution est élevée, vous avez besoin de plus de largeur et de hauteur.

Answer 4

J'ai eu cette erreur lorsque j'ai essayé de tracer des données à haute dimension. Si c'est ce qui se passe chez vous, essayez l'échelonnement multidimensionnel : http://www.statmethods.net/advstats/mds.html

Answer 5

J'ai lutté contre cette erreur pendant des semaines (en utilisant RStudio). J'ai essayé de déplacer la fenêtre de tracé plus grande et plus petite, mais cela n'a pas toujours aidé. Lorsque j'ai déplacé (fait glisser) l'application sur mon écran plus grand, le problème a disparu ! J'étais stupéfait... tant d'heures gaspillées... Je savais que mon code était correct...