Erreur dans plot.new() : marges de la figure trop grandes en R

Question

Je suis novice en R mais j'ai déjà réalisé de nombreux graphiques de corrélation avec des ensembles de données plus petits. Cependant, lorsque j'essaie de tracer un grand ensemble de données (2 Go et plus), je peux produire le tracé sans problème, mais la légende ne s'affiche pas. Des conseils ? ou des alternatives ?

library(gplots)
r.cor <- cor(r)
layout(matrix(c(1,1,1,1,1,1,1,1,2,2), 5, 2, byrow = TRUE))
par(oma=c(5,7,1,1))
cx <- rev(colorpanel(25,"yellow","black","blue"))
leg <- seq(min(r.cor,na.rm=T),max(r.cor,na.rm=T),length=10)
image(r.cor,main="Correlation plot Normal/Tumor data",axes=F,col=cx)
axis(1, at=seq(0,1,length=ncol(r.cor)), labels=dimnames(r.cor)[[2]], 
    cex.axis=0.9,las=2)
axis(2,at=seq(0,1,length=ncol(r.cor)), labels=dimnames(r.cor)[[2]],
     cex.axis=0.9,las=2)
image(as.matrix(leg),col=cx,axes=T)     

Erreur dans plot.new() : marges des chiffres trop importantes

tmp <- round(leg,2)
axis(1,at=seq(0,1,length=length(leg)), labels=tmp,cex.axis=1)

Answer 1

Si la marge est faible, il est toujours préférable de commencer par un nouveau dispositif de traçage :

dev.new()
# plot()
# save your plot
dev.off()

Vous n'obtiendrez jamais d'erreur de marge, à moins que vous ne traciez quelque chose de grand qui ne puisse être accommodé.

Answer 2

Le canevas de RStudio Plots limite la largeur et la hauteur des tracés. Cependant, si vous créez votre tracé à partir de Rmarkdown Le code chunk fonctionne sans limitation du champ de toile car la zone de traçage est définie en fonction de la taille du papier.

Par exemple :

    ```{r}
#inside of code chunk in Rmarkdown
        grid <- par(mfrow=c(4, 5))
        plot(faithful, main="Faithful eruptions")
        plot(large.islands, main="Islands", ylab="Area")
        ...
        par(grid)
    ```

Answer 3

J'ai trouvé la même erreur aujourd'hui. J'ai essayé le bouton "Clear all Plots", mais cela me donnait la même erreur. Alors cette astuce a fonctionné pour moi, Essayez d'augmenter la surface de la parcelle en la faisant glisser. Cela vous aidera certainement.

Answer 4

J'ai juste utilisé la commande Clear all plots puis à nouveau la commande plot et cela a été utile.