Suppression d'une colonne entière d'un data.frame en R

Question

Quelqu'un sait-il comment supprimer une colonne entière d'un cadre de données dans R ? Par exemple, si l'on me donne ce cadre de données :

> head(data)
   chr       genome region
1 chr1 hg19_refGene    CDS
2 chr1 hg19_refGene   exon
3 chr1 hg19_refGene    CDS
4 chr1 hg19_refGene   exon
5 chr1 hg19_refGene    CDS
6 chr1 hg19_refGene   exon

et je veux supprimer la 2ème colonne.

Answer 1

Vous pouvez le régler sur NULL .

> Data$genome <- NULL
> head(Data)
   chr region
1 chr1    CDS
2 chr1   exon
3 chr1    CDS
4 chr1   exon
5 chr1    CDS
6 chr1   exon

Comme indiqué dans les commentaires, voici d'autres possibilités :

Data[2] <- NULL    # Wojciech Sobala
Data[[2]] <- NULL  # same as above
Data <- Data[,-2]  # Ian Fellows
Data <- Data[-2]   # same as above

Vous pouvez supprimer plusieurs colonnes via :

Data[1:2] <- list(NULL)  # Marek
Data[1:2] <- NULL        # does not work!

Soyez prudent avec le sous-ensemble de la matrice, car vous pouvez vous retrouver avec un vecteur :

Data <- Data[,-(2:3)]             # vector
Data <- Data[,-(2:3),drop=FALSE]  # still a data.frame

Answer 2

Pour supprimer une ou plusieurs colonnes par leur nom, lorsque les noms des colonnes sont connus (et non pas déterminés au moment de l'exécution), j'aime la méthode subset() syntaxe. Par exemple, pour le cadre de données

df <- data.frame(a=1:3, d=2:4, c=3:5, b=4:6)

pour supprimer uniquement le a colonne que vous pourriez faire

Data <- subset( Data, select = -a )

et de retirer le b et d colonnes que vous pourriez faire

Data <- subset( Data, select = -c(d, b ) )

Vous pouvez supprimer toutes les colonnes entre d et b avec :

Data <- subset( Data, select = -c( d : b )

Comme je l'ai dit plus haut, cette syntaxe ne fonctionne que lorsque les noms des colonnes sont connus. Elle ne fonctionnera pas si les noms des colonnes sont déterminés par programme (c'est-à-dire s'ils sont assignés à une variable). Je vais reproduire cet avertissement à partir du ?subset documentation :

Attention :

Il s'agit d'une fonction pratique destinée à être utilisée de manière interactive. Pour la programmation, il est préférable d'utiliser les fonctions standard de sous-ensemble standard comme '[', et en particulier l'évaluation non standard de l'argument de l'argument 'subset' peut avoir des conséquences inattendues.

Answer 3

(Pour être complet) Si vous voulez supprimer les colonnes par nom, vous pouvez le faire :

cols.dont.want <- "genome"
cols.dont.want <- c("genome", "region") # if you want to remove multiple columns

data <- data[, ! names(data) %in% cols.dont.want, drop = F]

Y compris drop = F garantit que le résultat sera toujours un data.frame même s'il ne reste qu'une seule colonne.

Answer 4

Les réponses affichées sont très bonnes lorsque l'on travaille avec data.frame s. Cependant, ces tâches peuvent être assez inefficaces du point de vue de la mémoire. Avec des données volumineuses, la suppression d'une colonne peut prendre un temps anormalement long et/ou échouer à cause de out of memory erreurs. Paquet data.table contribue à résoudre ce problème avec le := opérateur :

library(data.table)
> dt <- data.table(a = 1, b = 1, c = 1)
> dt[,a:=NULL]
     b c
[1,] 1 1

Je devrais mettre en place un exemple plus important pour montrer les différences. Je mettrai cette réponse à jour à un moment donné.

Answer 5

Avec cela, vous pouvez supprimer le column et stocker variable dans un autre variable .

df = subset(data, select = -c(genome) )