Je ne pense pas qu'il s'agisse d'une solution fiable pour plusieurs raisons :
a) Habituellement, l'équipe de développement de magento met à jour les tables de la base de données mysql presque à chaque version (sans documentation appropriée), vous serez donc obligé de mettre à jour manuellement la structure de votre base de données après chaque changement (il n'est pas sage d'ignorer les mises à jour de magento, car elles corrigent une liste assez importante de bugs à chaque fois (et introduisent de nouveaux bugs en cours de route :P)).
b) La structure de la base de données de Magento est très complexe, et ce serait un travail infernal de tout porter dans un autre type de SGBD avec ses propres raisonnements pour les clés externes et autres.
c) Et en dernier lieu : Je ne suis pas sûr que leur moteur de base de données supporte un nouveau type de SGBD (ce devrait être Zend_Db mais qui sait).
Je vous suggère de convaincre le client d'utiliser mysql (puisque vous auriez de toute façon besoin d'un serveur dédié pour faire tourner magento en douceur).