Désactiver les messages lors du chargement d'un paquet

Question

J'ai un paquetage dans R (ROCR) que je dois charger dans mon environnement R. Lors du chargement du package, une série de messages est imprimée. C'est normalement une bonne chose, mais comme la sortie de mon script R est utilisée pour une analyse ultérieure, je souhaite désactiver complètement cette sortie. Comment faire ? De plus, je préférerais le faire sans avoir à modifier ROCR du tout, afin que les futurs utilisateurs de ce script n'aient pas à le faire non plus.

Jusqu'à présent :

• sink() ne fonctionne pas ici - redirigeant à la fois stdout et std err vers /dev/null ne m'apporte rien.
• Sans surprise, options(warnings=-1) ne fait rien non plus, puisque ce ne sont pas des avertissements en tant que tels qui sont imprimés.

Qu'en pensez-vous ?

Answer 1

Il suffit d'utiliser suppressMessages() autour de votre library() appel :

edd@max:~$ R

R version 2.14.1 (2011-12-22)
Copyright (C) 2011 The R Foundation for Statistical Computing
ISBN 3-900051-07-0
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
[...]

R> suppressMessages(library(ROCR))
R>                                               # silently loaded
R> search() 
 [1] ".GlobalEnv"         "package:ROCR"         # it's really there      
 [3] "package:gplots"     "package:KernSmooth"
 [5] "package:grid"       "package:caTools"   
 [7] "package:bitops"     "package:gdata"     
 [9] "package:gtools"     "package:stats"     
[11] "package:graphics"   "package:grDevices" 
[13] "package:utils"      "package:datasets"  
[15] "package:methods"    "Autoloads"         
[17] "package:base"      
R>

Answer 2

Réponse de Dirk supprime tous les messages et n'est pas spécifique aux messages générés lors du chargement des paquets.

La solution la plus exacte à la question posée est la suivante :

suppressPackageStartupMessages(library("THE_PACKAGE_NAME"))

Une explication un peu plus détaillée peut être trouvée aquí

Answer 3

Utilisation suppressPackageStartupMessages voir la réponse de MehradMahmoudian . Par souci d'exhaustivité, nous ajoutons ici des exemples d'utilisation :

Pour une bibliothèque, utilisez suppressPackageStartupMessages(...) par exemple :

suppressPackageStartupMessages(library(ggplot2))

Pour plusieurs bibliothèques, utilisez suppressPackageStartupMessages({...}) par exemple :

suppressPackageStartupMessages({
    library(ggplot2)
    library(ggdendro)
})

VOIR AUSSI :
Supprimer les messages de démarrage des paquets

Answer 4

library(ROCR, quietly = TRUE) pourrait être une option plus élégante.

Answer 5

Si vous chargez des paquets avec une boucle for, vous devez alors taire la boucle complète comme je le montre ci-dessous au lieu de supprimer le message lorsque vous chargez la bibliothèque individuellement.

requiredPackages = c('plyr','dplyr','data.table')
suppressMessages(
 for (p in requiredPackages) {
  if (!require(p, character.only = TRUE)){
   install.packages(p)
  }
  library(p, character.only = TRUE)
 }
)