À partir de la documentation (Android Studio est basé sur Intellij IDEA) :
Quoi que vous fassiez dans IntelliJ IDEA, vous devez le faire dans le cadre d'un
projet. Un projet est une unité d'organisation qui représente un
solution complète de logiciels.
Votre produit fini peut être décomposé en une série de discret,
modules isolés, mais c'est une définition de projet qui leur apporte
ensemble et des liens entre eux dans un ensemble plus grand.
Pour Android, il signifie un projet par application, et un module par la bibliothèque et par application de test.
Il existe de multiples problèmes si vous essayez de créer plusieurs applications au sein d'un même projet. C'est possible, mais si vous essayez (comme je l'ai fait), vous verrez que presque tout est conçu pour fonctionner avec une seule application par projet.
Par exemple, il y a une option pour "reconstruire le projet", qui n'a pas de sens avec de multiples applications, de nombreux autres paramètres du projet serait inutile, et intégré dans la VCS système n'est pas idéal lorsque vous avez plusieurs référentiels.