Où R magasin de packages?

Question

L'installer.les packages() dans R est l'utilitaire de décompression automatique qui obtient et installer les paquets dans R.

1. Comment puis-je savoir ce répertoire R a choisi de stocker les paquets?

2. Comment puis-je modifier le répertoire dans lequel R magasins et accède à des paquets?

Answer 1

L'installer.paquets de commande recherche par le biais de la .libPaths variable. Voici ce que le mien est par défaut sur OSX:

> .libPaths()
[1] "/Library/Frameworks/R.framework/Resources/library"

Je n'ai pas installer les paquets par défaut, je préfère les avoir installés dans mon répertoire home. Dans mon .Rprofile, j'ai cette ligne:

.libPaths( "/Users/tex/lib/R" )

Cela ajoute le répertoire "/Users/tex/lib/R" sur le devant de la .libPaths variable.

Answer 2

Ceci est documenté dans le R de l'Installation et de la gestion " manuel fourni avec votre installation.

Sur ma machine sous Linux:

R> .libPaths()
[1] "/usr/local/lib/R/site-library" "/usr/lib/R/site-library"      
[3] "/usr/lib/R/library"           
R> 

ce qui signifie que le chemin d'accès par défaut est le premier de ces. Vous pouvez remplacer que par le biais d'un argument à la fois install.packages() (à partir de l'intérieur R) ou R CMD INSTALL (hors R).

Vous pouvez également remplacer par la définition de la R_LIBS_USER variable.

Answer 3

Merci pour l'orientation de la droite au-dessus de deux answerers. James Thompson suggestion qui a le mieux fonctionné pour les utilisateurs de Windows.

1. Allez à l'emplacement de votre R programme est installé. C'est dénommé R_Home dans la littérature. Une fois que vous le trouver, allez dans /etc sous-répertoire.

C:\R\R-2.10.1\etc

1. Sélectionnez le fichier dans ce dossier nommé Rprofile.site. Je l'ai ouvert avec VIM. Vous trouverez c'est un bare-bones fichier avec moins de 20 lignes de code. J'ai inséré le texte suivant à l'intérieur le code:

mon custom chemin de la bibliothèque

.libPaths=("C:/R/library")

-le commentaire ajouté à garder une trace de ce que j'ai fait pour le fichier.

1. Dans R, taper la .libPaths() fonction génère la première cible à C:/R/Library

REMARQUE: il y a probablement plus d'une façon d'atteindre cet objectif, mais d'autres méthodes que j'ai essayé ne fonctionne pas pour une raison quelconque.

Answer 4

C'est un document très utile montrant comment créer un répertoire local pour l'écriture de paquets, de la location de R le savoir etc..

http://www.stat.osu.edu/computer-support/mathstatistics-packages/installing-r-libraries-locally-your-home-directory