Spécifier les colClasses dans le fichier read.csv

Question

J'essaie d'indiquer le colClasses dans la section read.csv dans R. Dans mes données, la première colonne time est essentiellement un vecteur de caractères, tandis que le reste des colonnes sont numériques.

data <- read.csv("test.csv", comment.char="" , 
                 colClasses=c(time="character", "numeric"), 
                 strip.white=FALSE)

Dans la commande ci-dessus, je veux que R lise le fichier time comme "caractère" et les autres comme numériques. Bien que le data variable a obtenu le résultat correct après la fin de la commande, R a renvoyé les avertissements suivants. Je me demande comment je peux corriger ces avertissements ?

Messages d'avertissement :
1 : Dans read.table(file = file, header = header, sep = sep, quote = quote, : toutes les colonnes nommées dans 'colClasses' n'existent pas.
2 : Dans tmp[i[i > 0L]] <- colClasses : le nombre d'éléments à remplacer n'est pas un multiple de la longueur de remplacement

Derek

Answer 1

Vous pouvez spécifier la colClasse pour une seule colonne.

Ainsi, dans votre exemple, vous devriez utiliser :

data <- read.csv('test.csv', colClasses=c("time"="character"))

Answer 2

Le vecteur colClasses doit avoir une longueur égale au nombre de colonnes importées. Si l'on suppose que le reste des colonnes de votre ensemble de données sont 5 :

colClasses=c("character",rep("numeric",5))

Answer 3

En supposant que votre colonne 'time' a au moins une observation avec un caractère non-numérique et que toutes vos autres colonnes n'ont que des nombres, alors le défaut de 'read.csv sera de lire 'time' comme un 'facteur' et toutes les autres colonnes comme 'numériques'. Par conséquent, la définition de 'stringsAsFactors=F' aura le même résultat que la définition manuelle de 'colClasses', c'est-à-dire..,

data <- read.csv('test.csv', stringsAsFactors=F)

Answer 4

Si vous voulez vous référer aux noms de l'en-tête plutôt qu'aux numéros de colonne, vous pouvez utiliser quelque chose comme ceci :

fname <- "test.csv"
headset <- read.csv(fname, header = TRUE, nrows = 10)
classes <- sapply(headset, class)
classes[names(classes) %in% c("time")] <- "character"
dataset <- read.csv(fname, header = TRUE, colClasses = classes)

Answer 5

Je sais que l'OP a demandé à propos de la utils::read.csv mais permettez-moi de fournir une réponse pour ceux qui viennent ici en cherchant comment le faire en utilisant la fonction readr::read_csv du tidyverse.

read_csv ("test.csv", col_names=FALSE, col_types = cols (.default = "c", time = "i"))

Cela devrait définir le type par défaut de toutes les colonnes en tant que caractère alors que temps sera interprété comme un nombre entier.