Fichier d'environnement pour l'exportation d'Anaconda

Question

Comment puis-je créer un fichier d'environnement anaconda qui pourrait être utilisé sur d'autres ordinateurs ?

J'ai exporté mon environnement python anaconda vers YML en utilisant conda env export > environment.yml . L'export environment.yml contient cette ligne prefix: /home/superdev/miniconda3/envs/juicyenv qui correspond à l'emplacement de mon anaconda, qui sera différent sur d'autres ordinateurs.

Answer 1

Je ne trouve rien dans le conda qui vous permettent d'exporter un fichier d'environnement sans l'option prefix: ... ligne. Cependant, comme Alex a fait remarquer dans les commentaires, conda ne semble pas se soucier de la ligne de préfixe lors de la création d'un environnement à partir d'un fichier.

En gardant cela à l'esprit, si vous voulez que l'autre utilisateur n'ait aucune connaissance de votre chemin d'installation par défaut, vous pouvez supprimer la ligne de préfixe avec grep avant d'écrire à environment.yml .

conda env export | grep -v "^prefix: " > environment.yml

Dans tous les cas, l'autre utilisateur s'exécute alors :

conda env create -f environment.yml

et l'environnement sera installé dans leur chemin d'environnement conda par défaut.

Si vous souhaitez spécifier un chemin d'installation différent de celui par défaut de votre système (non lié à 'prefix' dans le fichier environment.yml), il suffit d'utiliser la commande -p suivi du chemin d'accès requis.

conda env create -f environment.yml -p /home/user/anaconda3/envs/env_name

Notez que Conda recommande de créer le fichier environment.yml à la main, ce qui est particulièrement important si vous souhaitez partager votre environnement entre plusieurs plateformes (Windows/Linux/Mac). Dans ce cas, vous pouvez simplement laisser de côté l'option prefix ligne.

Answer 2

La manière la plus simple de sauvegarder les paquets d'un environnement pour les installer sur un autre ordinateur est la suivante :

$ conda list -e > req.txt

alors vous pouvez installer l'environnement en utilisant

$ conda create -n <environment-name> --file req.txt

si vous utilisez pip veuillez utiliser les commandes suivantes : référence https://pip.pypa.io/en/stable/reference/pip_freeze/

$ env1/bin/pip freeze > requirements.txt
$ env2/bin/pip install -r requirements.txt

Answer 3

• Linux

  conda env export --no-builds | grep -v "prefix" > environment.yml

• Windows

  conda env export --no-builds | findstr -v "prefix" > environment.yml

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Justification : Par défaut, conda env export comprend les informations de construction :

$ conda env export
...
dependencies:
  - backcall=0.1.0=py37_0
  - blas=1.0=mkl
  - boto=2.49.0=py_0
...

Vous pouvez au contraire exporter votre environnement sans info de construction :

$ conda env export --no-builds
...
dependencies:
  - backcall=0.1.0
  - blas=1.0
  - boto=2.49.0
...

Ce qui détache l'environnement de la version de Python et du système d'exploitation.

Answer 4

1. Activez d'abord votre environnement Conda (celui que vous voulez exporter/sauvegarder).

   conda activate myEnv

2. Exporter tous les paquets dans un fichier (myEnvBkp.txt)

   conda list --explicit > myEnvBkp.txt

3. Restaurer/importer l'environnement :

   conda create --name myEnvRestored --file myEnvBkp.txt

Answer 5

Activez d'abord votre environnement Conda (ci-dessous, myenv est le nom supposé de l'environnement).

conda activate myenv

Ensuite, il vous suffit d'exécuter cette commande

conda env export > environment.yml

Notez que vous pouvez remplacer environment.yml par tout autre nom de fichier de votre choix.