Utiliser R pour lister tous les fichiers avec une extension spécifiée

Question

Je suis très nouveau sur R et je travaille à mettre à jour un script R pour itérer à travers une série de tables .dbf créées à l'aide d'ArcGIS et produire une série de graphiques.

J'ai un répertoire, C:\Scratch, qui contiendra tous mes fichiers .dbf. Cependant, lorsque ArcGIS crée ces tables, il inclut également un fichier .dbf.xml. Je veux supprimer ces fichiers .dbf.xml de ma liste de fichiers et donc de mon itération. J'ai essayé de chercher et d'expérimenter avec des expressions régulières en vain. Voici l'expression de base que j'utilise (en excluant toutes les expérimentations variées) :

files <- list.files(pattern = "dbf")

Quelqu'un peut-il me donner une direction?

Answer 1

files <- list.files(pattern = "\\.dbf$")

$ à la fin signifie que c'est la fin de la chaîne. "dbf$" fonctionne également, mais en ajoutant \\. (. est un caractère spécial dans les expressions régulières, il faut donc l'échapper), vous vous assurez de ne faire correspondre que des fichiers avec l'extension .dbf (dans le cas où vous avez par exemple des fichiers .adbf).

Pour ignorer la casse, utilisez :

files <- list.files(pattern = "\\.dbf$", ignore.case = TRUE)

pour correspondre par exemple à : FILE.DBF.

Answer 2

Essayez ceci qui utilise des globales plutôt que des expressions régulières afin de ne choisir que les noms de fichiers se terminant par .dbf

filenames <- Sys.glob("*.dbf")

Answer 3

Fixez le motif pour trouver "\\.dbf" à la fin de la chaîne en utilisant le caractère $ :

list.files(pattern = "\\.dbf$")

Answer 4

Vous donne la liste des fichiers avec le chemin complet :

  Sys.glob(file.path(file_dir, "*.dbf")) ## file_dir = fichier contenant le répertoire

Answer 5

Je ne suis pas très bon pour utiliser des expressions régulières sophistiquées, donc je ferais cette tâche de la manière suivante :

files <- list.files()
dbf.files <- files[-grep(".xml", files, fixed=T)]

La première ligne liste simplement tous les fichiers du répertoire de travail. La deuxième supprime tout ce qui contient ".xml" (grep renvoie les indices de ces chaînes dans le vecteur 'files'; la sous-sélection avec des indices négatifs supprime les entrées correspondantes du vecteur). L'argument "fixed" pour la fonction grep est juste un caprice de ma part, car je veux généralement qu'il effectue une correspondance de modèle grossière sans les expressions régulières de style Perl, qui pourraient me causer des surprises.

Je suis conscient que cette solution simplement reflète les lacunes dans mon éducation, mais pour un novice, cela pourrait être utile =) au moins, c'est facile.