Comment mettre à jour un environnement Conda existant avec un fichier .yml ?

Question

Comment mettre à jour un environnement Conda préexistant avec un autre fichier .yml ? Ceci est extrêmement utile lorsque l'on travaille sur des projets qui ont de multiples fichiers d'exigences, c'est-à-dire base.yml, local.yml, production.yml etc.

Par exemple, vous trouverez ci-dessous un base.yml a les paquets conda-forge, conda, et pip :

base.yml

name: myenv
channels:
  - conda-forge
dependencies:
  - django=1.10.5
  - pip:
    - django-crispy-forms==1.6.1

L'environnement réel est créé avec : conda env create -f base.yml .

Par la suite, des paquets supplémentaires doivent être ajoutés à base.yml . Un autre fichier, par exemple local.yml doit importer ces mises à jour.

Les tentatives précédentes pour y parvenir comprennent :

la création d'un local.yml avec une définition d'importation :

channels:

dependencies:
  - pip:
    - boto3==1.4.4
imports:
  - requirements/base. 

Et puis lancez la commande : conda install -f local.yml .

Cela ne fonctionne pas. Une idée ?

Answer 1

Essayez d'utiliser mise à jour de conda env. :

conda activate myenv
conda env update --file local.yml --prune

--prune désinstalle les dépendances qui ont été supprimées de l'application local.yml comme indiqué dans cette réponse par @Blink.

Ou sans avoir besoin d'activer l'environnement (merci @NumesSanguis) :

conda env update --name myenv --file local.yml --prune

Voir Mise à jour d'un environnement dans le Guide de l'utilisateur de Conda.

Answer 2

La réponse proposée est partiellement correcte. Vous devez ajouter le --prune pour désinstaller également les paquets qui ont été supprimés de l'environnement.yml. Commande correcte :

conda env update -f local.yml --prune

Answer 3

La réponse d'alkamid est dans la bonne ligne, mais j'ai constaté que Conda ne parvient pas à installer de nouvelles dépendances si l'environnement est déjà actif. La désactivation préalable de l'environnement résout ce problème :

source deactivate;
conda env update -f whatever.yml;
source activate my_environment_name; # Must be AFTER the conda env update line!