Programmation de R script

Question

J'ai écrit un R script qui extrait des données d'une base de données, effectue plusieurs opérations sur celles-ci et envoie la sortie vers une nouvelle base de données.

Je voudrais que ce script s'exécute tous les jours à une heure précise mais je ne trouve aucun moyen de le faire efficacement.

Quelqu'un peut-il me recommander une ressource que je pourrais consulter pour résoudre ce problème ? J'exécute ce script sur une machine Windows.

Answer 1

En fait, sous Windows, il n'est même pas nécessaire de créer d'abord un fichier de traitement par lots pour utiliser l'outil de gestion de l'information. Planificateur .

• Ouvrez le programmateur : DÉMARRER -> Tous les programmes -> Accesoires -> Outils système -> Programmateur
• Créer un nouvelle tâche
• sous l'onglet Action, créez un nouvelle action
• choisissez Programme de démarrage
• naviguer vers Rscript.exe qui devrait être placé, par exemple, ici :
  " C:\Program Fichiers \R\R -3.0.2 \bin\x64\Rscript.exe "
• saisissez le nom de votre fichier dans le champ paramètres champ
• saisir le chemin où le script doit se trouver dans le fichier Commencez par champ
• aller au Déclencheurs onglet
• créer nouveau déclencheur
• choisir la tâche à accomplir chaque jour mois, ... répété plusieurs fois, ou ce que vous voulez.

Answer 2

Supposons que votre script R est mytest.r situé à D:\mydocuments\ vous pouvez créer un fichier batch comprenant la commande suivante :

C:\R\R-2.10.1\bin\Rcmd.exe BATCH D:\mydocuments\mytest.r

Ajoutez-le ensuite, en tant que nouvelle tâche, au planificateur de tâches de Windows, en y définissant les conditions de déclenchement.

Vous pouvez également omettre le fichier batch. Définir C:\R\R-2.10.1\bin\Rcmd.exe dans le program/script dans le planificateur de tâches, et donnez-lui le nom de Arguments le reste de la commande initiale : BATCH D:\mydocuments\mytest.r

Planification des tâches R via le planificateur de tâches de Windows (Publié le 11 février 2015)

taskscheduleR : paquet R pour planifier les scripts R avec le gestionnaire de tâches de Windows (Publié le 17 mars 2016)

EDITAR

J'ai récemment adopté à nouveau l'utilisation des fichiers batch, car je voulais que la fenêtre cmd soit réduite au minimum (je n'ai pas trouvé d'autre moyen).

Plus précisément, je remplis le planificateur de tâches de Windows Actions comme suit :

Program/script:

cmd.exe

Add arguments (optional):

/c start /min D:\mydocuments\mytest.bat ^& sortie

Contenu de mytest.bat :

C:\R\R -3.5.2 \bin\x64\Rscript.exe D:\mydocuments\mytest.r paramètres

Answer 3

Il y a maintenant une option intégrée dans RStudio pour le faire, pour exécuter le planificateur, installez d'abord les paquets suivants

  install.packages('data.table')
  install.packages('knitr')
  install.packages('miniUI')
  install.packages('shiny')
  install.packages("taskscheduleR", repos = "http://www.datatailor.be/rcube", type = 
  "source")

Après l'installation, allez à

**TOOLS -> ADDINS ->BROWSE ADDINS ->taskscheduleR -> Select it and execute it.**

Answer 4

Configuration du planificateur de tâches

Étape 1) Ouvrir le planificateur de tâches (Démarrer > rechercher Planificateur de tâches)

Étape 2) Cliquez sur "Action" > "Créer une tâche".

Étape 3) Sélectionnez "Exécuter uniquement lorsque l'utilisateur est connecté", décochez "Exécuter avec les plus hauts privilèges", nommez votre tâche, configurer pour "Windows Vista/Windows Server 2008".

Étape 4) Sous l'onglet "Triggers", définissez quand vous souhaitez que le script s'exécute.

Étape 5) Sous l'onglet "Actions", indiquez l'emplacement complet du fichier Rscript.exe, à savoir

"C:\Program Files\R\R-3.6.2\bin\Rscript.exe" (include the quotes)

Mettez le nom de votre script avec l'option -e y source() en arguments l'enveloppant comme ceci :

-e "source('C:/location_of_my_script/test.R')"

Dépannage d'un Rscript planifié dans le planificateur de tâches

Lorsque vous exécutez un script à l'aide du planificateur de tâches, il est difficile de résoudre les problèmes car vous n'obtenez aucun message d'erreur.

Ce problème peut être résolu en utilisant l'option sink() dans R qui vous permettra de sortir tous les messages d'erreur dans un fichier que vous spécifiez. Voici comment vous pouvez procéder :

# Set up error log ------------------------------------------------------------
error_log <- file("C:/location_of_my_script/error_log.Rout", open="wt")
sink(error_log, type="message")

try({

# insert your code here

})

L'autre chose que vous devrez modifier pour que votre Rscript fonctionne est de spécifier le chemin complet de tout fichier dans votre script.

Cela ne fonctionnera pas dans le planificateur de tâches :

source("./functions/import_function.R")

Vous devrez spécifier le chemin d'accès complet de tous les scripts dont vous vous approvisionnez dans votre Rscript :

source("C:/location_of_my_script/functions/import_function.R")

De plus, je supprimerais tous les caractères spéciaux de tous les chemins de fichiers auxquels vous faites référence dans votre scriptR. Par exemple :

df <- fread("C:/location_of_my_data/file#2342.csv")

peut ne pas fonctionner. Essayez plutôt :

df <- fread("C:/location_of_my_data/file_2342.csv")

Changer les mots de passe de Windows Méfiez-vous : Le changement des mots de passe Windows mettra en pause votre script(s) du planificateur de tâches. Vous devrez vous reconnecter au planificateur de tâches et entrer votre mot de passe pour les faire redémarrer.

Answer 5

Je configure mes tâches via le SCHTASKS programme. Pour l'exécution de scripts au démarrage, vous écrirez quelque chose de l'ordre de

SCHTASKS /Create /SC ONSTART /TN MyProgram /TR "R CMD BATCH --vanilla d:\path\to\script.R"

Voir ce site web pour plus de détails sur SCHTASKS . Pour plus de détails, voir Site web de Microsoft .