Existe-t-il un moyen dans CMake de forcer un chemin spécifié par include_directories (ou peut-être par une autre fonction) à utiliser l'indicateur -isystem au lieu de l'indicateur -I lors de la construction avec gcc?
Voir http://gcc.gnu.org/onlinedocs/gcc/Directory-Options.html#Directory-Options pour plus de détails sur -I et -isystem.