Comment afficher du code mais masquer la sortie dans RMarkdown ?

Question

Je veux que mon fichier html affiche le code, mais pas la sortie de ce chunk:

```{r echo=True, include=FALSE}
fun <- function(b)
    {
    for(a in b)
        {print(a)
        return(a * a)}
    }
y <- fun(b)
```

Quand j'exécute le code, j'ai besoin de voir l'impression pour suivre le progrès (c'est une fonction assez longue en réalité).

Mais dans le fichier knitr, j'utilise la sortie dans un autre chunk, donc je ne veux pas la voir dans celui-ci (et il n'y a pas de notion de progrès, puisque le code a déjà été exécuté).

Ce echo=True, include=FALSE ici ne fonctionne pas: le tout est caché (ce qui est le comportement normal de include=FALSE).

Quels sont les paramètres que je pourrais utiliser pour masquer les impressions, mais montrer mon code?

Answer 1

Comme l'a mentionné @ J_F dans les commentaires, en utilisant {r echo = T, results = 'hide'}.

Je voulais approfondir leur réponse - il existe de nombreuses ressources auxquelles vous pouvez accéder pour déterminer toutes les options possibles pour votre chunk et l'affichage de la sortie - j'en garde une version imprimée sur mon bureau!

Vous pouvez les trouver soit sur le site Web de RStudio sous Cheat Sheets (rechercher la triche R Markdown et le guide de référence R Markdown) ou, dans RStudio, accéder à l'onglet "Aide", choisir "Cheat Sheets", et rechercher les mêmes documents là-bas.

Enfin, pour définir les options par défaut du chunk, vous pouvez exécuter (dans votre premier chunk) quelque chose comme le code suivant si vous souhaitez que la plupart des chunks aient le même comportement:

```{r setup, include=FALSE}
knitr::opts_chunk$set(echo = T,
                      results = "hide")
```

Plus tard, vous pouvez modifier le comportement des chunks individuels comme ceci, ce qui remplacera la valeur par défaut pour l'option de résultats uniquement.

```{r analysis, results="markup"}
# code ici
```

Answer 2

La results = 'hide' option ne permet pas d'empêcher l'affichage d'autres messages. Pour les cacher, les options suivantes sont utiles :

• {r, error=FALSE}
• {r, warning=FALSE}
• {r, message=FALSE}

Dans tous les cas, le message d'erreur, d'avertissement ou de message correspondant sera affiché dans la console à la place.

Answer 3

```{r eval=FALSE}

Le document affichera le code par défaut mais empêchera l'exécution du bloc de code, et donc n'affichera pas non plus de résultats.

Answer 4

Pour masquer les codes library("nom_de_la_bibliotheque"), simplement montrer les codes, {r loadlib, echo=T, results='hide', message=F, warning=F} est excellent. Et à mon avis, c'est une meilleure façon que library(package, warn.conflicts=F, quietly=T)

Answer 5

Pour masquer les avertissements, vous pouvez également faire {r, warning=FALSE}