Si vous demandez la suppression d'un projet de GitHub, ouvrez votre projet, cliquez sur l'onglet "Admin" (ou naviguez directement à l'adresse suivante https://github.com/username/project_name/edit ) et en bas de la page, cliquez sur "Supprimer ce référentiel". Il vous sera demandé de confirmer, puis il disparaîtra.
Si vous souhaitez simplement effacer une partie de votre dépôt, vous devez le faire sur votre dépôt git et le pousser sur GitHub.
GitHub a écrit un mode d'emploi à ce sujet dans leur FAQ. Je n'ai pas essayé moi-même, donc je ne peux pas vous guider plus loin, mais vous pouvez probablement gérer cela vous-même à partir de maintenant.
Dans un cas comme dans l'autre, cela ne supprime pas les extractions de tiers - si quelqu'un a extrait le dépôt avant que vous l'ayez supprimé, il est sorti, sans que vous puissiez y faire grand chose (à part essayer la technique du "s'il vous plaît").