Comprendre les logs de Linux oom-killer

Question

Mon application a été tuée par le oom-killer. C'est Ubuntu 11.10 qui fonctionne sur une clé USB sans swap et le PC a 1 Gig de RAM. La seule application en cours d'exécution (en dehors de tous les éléments intégrés à Ubuntu) est mon programme flasherav. Notez que /tmp est mappé en mémoire et qu'au moment de la panne, il contenait environ 200 Mo de fichiers (et occupait donc environ 200 Mo de RAM).

J'essaie de comprendre comment analyser le journal d'om-killer de manière à pouvoir comprendre où exactement toute la mémoire est utilisée - c'est-à-dire quels sont les différents morceaux qui s'additionnent pour atteindre ~1 giga et qui ont entraîné le déclenchement d'om-killer ? Une fois que j'ai compris cela, je peux travailler sur la réduction de l'utilisation du délinquant afin que l'application fonctionne sur une machine avec 1 Go de ram. Mes questions spécifiques sont les suivantes.

Pour essayer d'analyser la situation, j'ai additionné la colonne "total_vm" et je n'ai obtenu que 609342KB (ce qui, ajouté aux 200MB dans /tmp, ne fait toujours que 809MB). Peut-être que je me trompe sur ce qu'est la colonne "total_vm" - inclut-elle la mémoire allouée mais non utilisée plus la mémoire partagée. Si oui, cela ne devrait-il pas surestimer la mémoire réellement utilisée (et donc je ne devrais pas être à court de mémoire), n'est-ce pas ? Y a-t-il d'autres morceaux de mémoire utilisés qui ne sont pas pris en compte dans la liste ci-dessous ?

[11686.040460] flasherav invoked oom-killer: gfp_mask=0x201da, order=0, oom_adj=0, oom_score_adj=0
[11686.040467] flasherav cpuset=/ mems_allowed=0
[11686.040472] Pid: 2859, comm: flasherav Not tainted 3.0.0-12-generic #20-Ubuntu
[11686.040476] Call Trace:
[11686.040488]  [<c10e1c15>] dump_header.isra.7+0x85/0xc0
[11686.040493]  [<c10e1e6c>] oom_kill_process+0x5c/0x80
[11686.040498]  [<c10e225f>] out_of_memory+0xbf/0x1d0
[11686.040503]  [<c10e6123>] __alloc_pages_nodemask+0x6c3/0x6e0
[11686.040509]  [<c10e78d3>] ? __do_page_cache_readahead+0xe3/0x170
[11686.040514]  [<c10e0fc8>] filemap_fault+0x218/0x390
[11686.040519]  [<c1001c24>] ? __switch_to+0x94/0x1a0
[11686.040525]  [<c10fb5ee>] __do_fault+0x3e/0x4b0
[11686.040530]  [<c1069971>] ? enqueue_hrtimer+0x21/0x80
[11686.040535]  [<c10fec2c>] handle_pte_fault+0xec/0x220
[11686.040540]  [<c10fee68>] handle_mm_fault+0x108/0x210
[11686.040546]  [<c152fa00>] ? vmalloc_fault+0xee/0xee
[11686.040551]  [<c152fb5b>] do_page_fault+0x15b/0x4a0
[11686.040555]  [<c1069a90>] ? update_rmtp+0x80/0x80
[11686.040560]  [<c106a7b6>] ? hrtimer_start_range_ns+0x26/0x30
[11686.040565]  [<c106aeaf>] ? sys_nanosleep+0x4f/0x60
[11686.040569]  [<c152fa00>] ? vmalloc_fault+0xee/0xee
[11686.040574]  [<c152cfcf>] error_code+0x67/0x6c
[11686.040580]  [<c1520000>] ? reserve_backup_gdb.isra.11+0x26d/0x2c0
[11686.040583] Mem-Info:
[11686.040585] DMA per-cpu:
[11686.040588] CPU    0: hi:    0, btch:   1 usd:   0
[11686.040592] CPU    1: hi:    0, btch:   1 usd:   0
[11686.040594] Normal per-cpu:
[11686.040597] CPU    0: hi:  186, btch:  31 usd:   5
[11686.040600] CPU    1: hi:  186, btch:  31 usd:  30
[11686.040603] HighMem per-cpu:
[11686.040605] CPU    0: hi:   42, btch:   7 usd:   7
[11686.040608] CPU    1: hi:   42, btch:   7 usd:  22
[11686.040613] active_anon:113150 inactive_anon:113378 isolated_anon:0
[11686.040615]  active_file:86 inactive_file:1964 isolated_file:0
[11686.040616]  unevictable:0 dirty:0 writeback:0 unstable:0
[11686.040618]  free:13274 slab_reclaimable:2239 slab_unreclaimable:2594
[11686.040619]  mapped:1387 shmem:4380 pagetables:1375 bounce:0
[11686.040627] DMA free:4776kB min:784kB low:980kB high:1176kB active_anon:5116kB inactive_anon:5472kB active_file:0kB inactive_file:0kB unevictable:0kB isolated(anon):0kB isolated(file):0kB present:15804kB mlocked:0kB dirty:0kB writeback:0kB mapped:0kB shmem:0kB slab_reclaimable:80kB slab_unreclaimable:168kB kernel_stack:96kB pagetables:64kB unstable:0kB bounce:0kB writeback_tmp:0kB pages_scanned:6 all_unreclaimable? yes
[11686.040634] lowmem_reserve[]: 0 865 1000 1000
[11686.040644] Normal free:48212kB min:44012kB low:55012kB high:66016kB active_anon:383196kB inactive_anon:383704kB active_file:344kB inactive_file:7884kB unevictable:0kB isolated(anon):0kB isolated(file):0kB present:885944kB mlocked:0kB dirty:0kB writeback:0kB mapped:5548kB shmem:17520kB slab_reclaimable:8876kB slab_unreclaimable:10208kB kernel_stack:1960kB pagetables:3976kB unstable:0kB bounce:0kB writeback_tmp:0kB pages_scanned:930 all_unreclaimable? yes
[11686.040652] lowmem_reserve[]: 0 0 1078 1078
[11686.040662] HighMem free:108kB min:132kB low:1844kB high:3560kB active_anon:64288kB inactive_anon:64336kB active_file:0kB inactive_file:0kB unevictable:0kB isolated(anon):0kB isolated(file):0kB present:138072kB mlocked:0kB dirty:0kB writeback:0kB mapped:0kB shmem:0kB slab_reclaimable:0kB slab_unreclaimable:0kB kernel_stack:0kB pagetables:1460kB unstable:0kB bounce:0kB writeback_tmp:0kB pages_scanned:61 all_unreclaimable? yes
[11686.040669] lowmem_reserve[]: 0 0 0 0
[11686.040675] DMA: 20*4kB 24*8kB 34*16kB 26*32kB 19*64kB 13*128kB 1*256kB 0*512kB 0*1024kB 0*2048kB 0*4096kB = 4784kB
[11686.040690] Normal: 819*4kB 607*8kB 357*16kB 176*32kB 99*64kB 49*128kB 23*256kB 4*512kB 0*1024kB 0*2048kB 2*4096kB = 48212kB
[11686.040704] HighMem: 16*4kB 0*8kB 1*16kB 0*32kB 0*64kB 0*128kB 0*256kB 0*512kB 0*1024kB 0*2048kB 0*4096kB = 80kB
[11686.040718] 14680 total pagecache pages
[11686.040721] 8202 pages in swap cache
[11686.040724] Swap cache stats: add 2191074, delete 2182872, find 1247325/1327415
[11686.040727] Free swap  = 0kB
[11686.040729] Total swap = 524284kB
[11686.043240] 262100 pages RAM
[11686.043244] 34790 pages HighMem
[11686.043246] 5610 pages reserved
[11686.043248] 2335 pages shared
[11686.043250] 240875 pages non-shared
[11686.043253] [ pid ]   uid  tgid total_vm      rss cpu oom_adj oom_score_adj name
[11686.043266] [ 1084]     0  1084      662        1   0       0             0 upstart-udev-br
[11686.043271] [ 1094]     0  1094      743       79   0     -17         -1000 udevd
[11686.043276] [ 1104]   101  1104     7232       42   0       0             0 rsyslogd
[11686.043281] [ 1149]   103  1149     1066      188   1       0             0 dbus-daemon
[11686.043286] [ 1165]     0  1165     1716       66   0       0             0 modem-manager
[11686.043291] [ 1220]   106  1220      861       42   0       0             0 avahi-daemon
[11686.043296] [ 1221]   106  1221      829        0   1       0             0 avahi-daemon
[11686.043301] [ 1255]     0  1255     6880      117   0       0             0 NetworkManager
[11686.043306] [ 1308]     0  1308     5988      144   0       0             0 polkitd
[11686.043311] [ 1334]     0  1334      723       85   0     -17         -1000 udevd
[11686.043316] [ 1335]     0  1335      730      108   0     -17         -1000 udevd
[11686.043320] [ 1375]     0  1375      663       37   0       0             0 upstart-socket-
[11686.043325] [ 1464]     0  1464     1333      120   1       0             0 login
[11686.043330] [ 1467]     0  1467     1333      135   1       0             0 login
[11686.043335] [ 1486]     0  1486     1333      135   1       0             0 login
[11686.043339] [ 1487]     0  1487     1333      136   1       0             0 login
[11686.043344] [ 1493]     0  1493     1333      134   1       0             0 login
[11686.043349] [ 1528]     0  1528      496       45   0       0             0 acpid
[11686.043354] [ 1529]     0  1529      607       46   1       0             0 cron
[11686.043359] [ 1549]     0  1549    10660      100   0       0             0 lightdm
[11686.043363] [ 1550]     0  1550      570       28   0       0             0 atd
[11686.043368] [ 1584]     0  1584      855       35   0       0             0 irqbalance
[11686.043373] [ 1703]     0  1703    17939     9653   0       0             0 Xorg
[11686.043378] [ 1874]     0  1874     7013      174   0       0             0 console-kit-dae
[11686.043382] [ 1958]     0  1958     1124       52   1       0             0 bluetoothd
[11686.043388] [ 2048]   999  2048     2435      641   1       0             0 bash
[11686.043392] [ 2049]   999  2049     2435      595   0       0             0 bash
[11686.043397] [ 2050]   999  2050     2435      587   1       0             0 bash
[11686.043402] [ 2051]   999  2051     2435      634   1       0             0 bash
[11686.043406] [ 2054]   999  2054     2435      569   0       0             0 bash
[11686.043411] [ 2155]     0  2155     1333      128   0       0             0 login
[11686.043416] [ 2222]     0  2222      684       67   1       0             0 dhclient
[11686.043420] [ 2240]   999  2240     2435      415   0       0             0 bash
[11686.043425] [ 2244]     0  2244     3631       58   0       0             0 accounts-daemon
[11686.043430] [ 2258]   999  2258    11683      277   0       0             0 gnome-session
[11686.043435] [ 2407]   999  2407      964       24   0       0             0 ssh-agent
[11686.043440] [ 2410]   999  2410      937       53   0       0             0 dbus-launch
[11686.043444] [ 2411]   999  2411     1319      300   1       0             0 dbus-daemon
[11686.043449] [ 2413]   999  2413     2287       88   0       0             0 gvfsd
[11686.043454] [ 2418]   999  2418     7867      123   1       0             0 gvfs-fuse-daemo
[11686.043459] [ 2427]   999  2427    32720      804   0       0             0 gnome-settings-
[11686.043463] [ 2437]   999  2437    10750      124   0       0             0 gnome-keyring-d
[11686.043468] [ 2442]   999  2442     2321      244   1       0             0 gconfd-2
[11686.043473] [ 2447]     0  2447     6490      156   0       0             0 upowerd
[11686.043478] [ 2467]   999  2467     7590       87   0       0             0 dconf-service
[11686.043482] [ 2529]   999  2529    11807      211   0       0             0 gsd-printer
[11686.043487] [ 2531]   999  2531    12162      587   0       0             0 metacity
[11686.043492] [ 2535]   999  2535    19175      960   0       0             0 unity-2d-panel
[11686.043496] [ 2536]   999  2536    19408     1012   0       0             0 unity-2d-launch
[11686.043502] [ 2539]   999  2539    16154     1120   1       0             0 nautilus
[11686.043506] [ 2540]   999  2540    17888      534   0       0             0 nm-applet
[11686.043511] [ 2541]   999  2541     7005      253   0       0             0 polkit-gnome-au
[11686.043516] [ 2544]   999  2544     8930      430   0       0             0 bamfdaemon
[11686.043521] [ 2545]   999  2545    11217      442   1       0             0 bluetooth-apple
[11686.043525] [ 2547]   999  2547      510       16   0       0             0 sh
[11686.043530] [ 2548]   999  2548    11205      301   1       0             0 gnome-fallback-
[11686.043535] [ 2565]   999  2565     6614      179   1       0             0 gvfs-gdu-volume
[11686.043539] [ 2567]     0  2567     5812      164   1       0             0 udisks-daemon
[11686.043544] [ 2571]     0  2571     1580       69   0       0             0 udisks-daemon
[11686.043549] [ 2579]   999  2579    16354     1035   0       0             0 unity-panel-ser
[11686.043554] [ 2602]     0  2602     1188       47   0       0             0 sudo
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[11686.043569] [ 2609]   999  2609    19313      311   1       0             0 indicator-datet
[11686.043573] [ 2611]   999  2611    15738      225   0       0             0 indicator-messa
[11686.043578] [ 2615]   999  2615    17433      237   1       0             0 indicator-sessi
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[11686.043588] [ 2640]   999  2640     1933       85   0       0             0 geoclue-master
[11686.043592] [ 2650]     0  2650     2498     1136   1       0             0 mount.ntfs
[11686.043598] [ 2657]   999  2657     6624      128   1       0             0 telepathy-indic
[11686.043602] [ 2659]   999  2659     2246      112   0       0             0 mission-control
[11686.043607] [ 2662]   999  2662     5431      346   1       0             0 gdu-notificatio
[11686.043612] [ 2664]     0  2664     3716     2392   0       0             0 mount.ntfs
[11686.043617] [ 2679]   999  2679    12453      197   1       0             0 zeitgeist-datah
[11686.043621] [ 2685]   999  2685     5196     1581   1       0             0 zeitgeist-daemo
[11686.043626] [ 2934]   999  2934    16305      710   0       0             0 gnome-terminal
[11686.043631] [ 2938]   999  2938      553        0   0       0             0 gnome-pty-helpe
[11686.043636] [ 2939]   999  2939     1814      406   0       0             0 bash
[11686.043641] Out of memory: Kill process 2603 (flasherav) score 761 or sacrifice child
[11686.043647] Killed process 2603 (flasherav) total-vm:1498536kB, anon-rss:721784kB, file-rss:4228kB

Answer 1

La gestion de la mémoire sous Linux est un peu délicate à comprendre, et je ne peux pas dire que je la comprenne encore complètement, mais je vais essayer de partager un peu de mon expérience et de mes connaissances.

Réponse courte à votre question : Oui, il y a d'autres choses incluses que celles de la liste.

Ce qui apparaît dans votre liste, ce sont les applications exécutées dans l'espace utilisateur. Le noyau utilise de la mémoire pour lui-même et pour les modules. En outre, il a une limite inférieure de mémoire libre que vous ne pouvez pas dépasser. Lorsque vous atteignez ce niveau, le noyau tente de libérer des ressources et lorsqu'il ne peut plus le faire, vous vous retrouvez avec un problème d'OOM.

A partir de la dernière ligne de votre liste, vous pouvez lire que le noyau rapporte une utilisation totale de la mémoire virtuelle de : 1498536kB (1,5GB), où le total-vm inclut à la fois votre RAM physique et votre espace d'échange. Vous avez déclaré que vous n'avez pas d'espace d'échange mais le noyau semble penser le contraire puisque votre espace d'échange est signalé comme étant plein (Total swap = 524284kB, Free swap = 0kB) et il rapporte une taille totale de vmem de 1,5GB.

Une autre chose qui peut compliquer encore les choses est la fragmentation de la mémoire. Vous pouvez atteindre le tueur d'OOM quand le noyau essaie d'allouer disons 4096kB de mémoire continue, mais il n'y a pas de mémoire libre disponible.

Maintenant, cela seul ne vous aidera probablement pas à résoudre le problème réel. Je ne sais pas s'il est normal que votre programme ait besoin de cette quantité de mémoire, mais je vous recommanderais d'essayer un analyseur de code statique comme cppcheck pour vérifier les fuites de mémoire ou les fuites de descripteurs de fichiers. Vous pouvez également essayer de le passer dans Valgrind pour obtenir un peu plus d'informations sur l'utilisation de la mémoire.

Answer 2

Somme de total_vm est 847170 et la somme de rss est 214726, ces deux valeurs sont comptées en pages de 4kB, ce qui signifie que lorsque oom-killer était en cours d'exécution, vous aviez utilisé 214726*4kB=858904kB de mémoire physique et d'espace swap.

Puisque votre mémoire physique est de 1GB et que ~200MB ont été utilisés pour le mapping de la mémoire, il est raisonnable d'invoquer oom-killer lorsque 858904kB ont été utilisés.

rss pour le processus 2603 est 181503, ce qui signifie que 181503*4KB=726012 rss, était égal à la somme de anon-rss et file-rss .

[11686.043647] Processus 2603 tué (flasherav) total-vm:1498536kB, anon-rss:721784kB, file-rss:4228kB

Answer 3

Cette page web ont une explication et une solution.

La solution est la suivante :

Pour résoudre ce problème, le comportement du noyau doit être modifié, afin qu'il ne surcommette plus la mémoire pour les demandes des applications. Enfin, j'ai inclus les valeurs mentionnées dans le fichier /etc/sysctl.conf, afin qu'elles soient automatiquement appliquées au démarrage :

vm.overcommit_memory = 2

vm.overcommit_ratio = 80