Suppression de la notation scientifique dans Numpy lors de la création d'un tableau à partir d'une liste imbriquée

Question

J'ai une liste Python imbriquée qui ressemble à ce qui suit :

my_list = [[3.74, 5162, 13683628846.64, 12783387559.86, 1.81],
 [9.55, 116, 189688622.37, 260332262.0, 1.97],
 [2.2, 768, 6004865.13, 5759960.98, 1.21],
 [3.74, 4062, 3263822121.39, 3066869087.9, 1.93],
 [1.91, 474, 44555062.72, 44555062.72, 0.41],
 [5.8, 5006, 8254968918.1, 7446788272.74, 3.25],
 [4.5, 7887, 30078971595.46, 27814989471.31, 2.18],
 [7.03, 116, 66252511.46, 81109291.0, 1.56],
 [6.52, 116, 47674230.76, 57686991.0, 1.43],
 [1.85, 623, 3002631.96, 2899484.08, 0.64],
 [13.76, 1227, 1737874137.5, 1446511574.32, 4.32],
 [13.76, 1227, 1737874137.5, 1446511574.32, 4.32]]

J'importe ensuite Numpy, et je règle les options d'impression sur (suppress=True) . Lorsque je crée un tableau :

my_array = numpy.array(my_list)

Je n'arrive pas à supprimer la notation scientifique :

[[  3.74000000e+00   5.16200000e+03   1.36836288e+10   1.27833876e+10
    1.81000000e+00]
 [  9.55000000e+00   1.16000000e+02   1.89688622e+08   2.60332262e+08
    1.97000000e+00]
 [  2.20000000e+00   7.68000000e+02   6.00486513e+06   5.75996098e+06
    1.21000000e+00]
 [  3.74000000e+00   4.06200000e+03   3.26382212e+09   3.06686909e+09
    1.93000000e+00]
 [  1.91000000e+00   4.74000000e+02   4.45550627e+07   4.45550627e+07
    4.10000000e-01]
 [  5.80000000e+00   5.00600000e+03   8.25496892e+09   7.44678827e+09
    3.25000000e+00]
 [  4.50000000e+00   7.88700000e+03   3.00789716e+10   2.78149895e+10
    2.18000000e+00]
 [  7.03000000e+00   1.16000000e+02   6.62525115e+07   8.11092910e+07
    1.56000000e+00]
 [  6.52000000e+00   1.16000000e+02   4.76742308e+07   5.76869910e+07
    1.43000000e+00]
 [  1.85000000e+00   6.23000000e+02   3.00263196e+06   2.89948408e+06
    6.40000000e-01]
 [  1.37600000e+01   1.22700000e+03   1.73787414e+09   1.44651157e+09
    4.32000000e+00]
 [  1.37600000e+01   1.22700000e+03   1.73787414e+09   1.44651157e+09
    4.32000000e+00]]

Si je crée un simple tableau numpy directement :

new_array = numpy.array([1.5, 4.65, 7.845])

Je n'ai aucun problème et l'impression se fait comme suit :

[ 1.5    4.65   7.845]

Quelqu'un sait-il quel est mon problème ?

Answer 1

C'est ce dont vous avez besoin :

np.set_printoptions(suppress=True)

Voici le documentation .

Answer 2

Python Force-supprime toute notation exponentielle lors de l'impression de numpy ndarrays, se débat avec la justification du texte, les arrondis et les options d'impression :

Ce qui suit est une explication de ce qui se passe, faites défiler vers le bas pour les démonstrations de code.

Passage d'un paramètre suppress=True à la fonction set_printoptions ne fonctionne que pour les nombres qui tiennent dans l'espace de 8 caractères qui leur est attribué par défaut, comme ceci :

import numpy as np
np.set_printoptions(suppress=True) #prevent numpy exponential 
                                   #notation on print, default False

#            tiny     med  large
a = np.array([1.01e-5, 22, 1.2345678e7])  #notice how index 2 is 8 
                                          #digits wide

print(a)    #prints [ 0.0000101   22.     12345678. ]

Cependant, si vous passez un nombre de plus de 8 caractères, la notation exponentielle est à nouveau imposée, comme ceci :

np.set_printoptions(suppress=True)

a = np.array([1.01e-5, 22, 1.2345678e10])    #notice how index 2 is 10
                                             #digits wide, too wide!

#exponential notation where we've told it not to!
print(a)    #prints [1.01000000e-005   2.20000000e+001   1.23456780e+10]

numpy a le choix entre couper votre nombre en deux, ce qui le dénature, ou forcer la notation exponentielle, il choisit la seconde solution.

Voici set_printoptions(formatter=...) à la rescousse pour spécifier les options d'impression et d'arrondi. Dites à set_printoptions pour juste imprimer un flotteur nu :

np.set_printoptions(suppress=True,
   formatter={'float_kind':'{:f}'.format})

a = np.array([1.01e-5, 22, 1.2345678e30])  #notice how index 2 is 30
                                           #digits wide.  

#Ok good, no exponential notation in the large numbers:
print(a)  #prints [0.000010 22.000000 1234567799999999979944197226496.000000] 

Nous avons supprimé de force la notation exponentielle, mais elle n'est ni arrondie ni justifiée, il faut donc spécifier des options de formatage supplémentaires :

np.set_printoptions(suppress=True,
   formatter={'float_kind':'{:0.2f}'.format})  #float, 2 units 
                                               #precision right, 0 on left

a = np.array([1.01e-5, 22, 1.2345678e30])   #notice how index 2 is 30
                                            #digits wide

print(a)  #prints [0.00 22.00 1234567799999999979944197226496.00]

L'inconvénient de la suppression forcée de toute notion exponentielle dans les ndarrays est que si votre ndarray contient une énorme valeur flottante proche de l'infini et que vous l'imprimez, vous allez vous prendre une page pleine de chiffres en pleine figure.

Exemple complet Démo 1 :

from pprint import pprint
import numpy as np
#chaotic python list of lists with very different numeric magnitudes
my_list = [[3.74, 5162, 13683628846.64, 12783387559.86, 1.81],
           [9.55, 116, 189688622.37, 260332262.0, 1.97],
           [2.2, 768, 6004865.13, 5759960.98, 1.21],
           [3.74, 4062, 3263822121.39, 3066869087.9, 1.93],
           [1.91, 474, 44555062.72, 44555062.72, 0.41],
           [5.8, 5006, 8254968918.1, 7446788272.74, 3.25],
           [4.5, 7887, 30078971595.46, 27814989471.31, 2.18],
           [7.03, 116, 66252511.46, 81109291.0, 1.56],
           [6.52, 116, 47674230.76, 57686991.0, 1.43],
           [1.85, 623, 3002631.96, 2899484.08, 0.64],
           [13.76, 1227, 1737874137.5, 1446511574.32, 4.32],
           [13.76, 1227, 1737874137.5, 1446511574.32, 4.32]]

#convert python list of lists to numpy ndarray called my_array
my_array = np.array(my_list)

#This is a little recursive helper function converts all nested 
#ndarrays to python list of lists so that pretty printer knows what to do.
def arrayToList(arr):
    if type(arr) == type(np.array):
        #If the passed type is an ndarray then convert it to a list and
        #recursively convert all nested types
        return arrayToList(arr.tolist())
    else:
        #if item isn't an ndarray leave it as is.
        return arr

#suppress exponential notation, define an appropriate float formatter
#specify stdout line width and let pretty print do the work
np.set_printoptions(suppress=True,
   formatter={'float_kind':'{:16.3f}'.format}, linewidth=130)
pprint(arrayToList(my_array))

Imprimés :

array([[           3.740,         5162.000,  13683628846.640,  12783387559.860,            1.810],
       [           9.550,          116.000,    189688622.370,    260332262.000,            1.970],
       [           2.200,          768.000,      6004865.130,      5759960.980,            1.210],
       [           3.740,         4062.000,   3263822121.390,   3066869087.900,            1.930],
       [           1.910,          474.000,     44555062.720,     44555062.720,            0.410],
       [           5.800,         5006.000,   8254968918.100,   7446788272.740,            3.250],
       [           4.500,         7887.000,  30078971595.460,  27814989471.310,            2.180],
       [           7.030,          116.000,     66252511.460,     81109291.000,            1.560],
       [           6.520,          116.000,     47674230.760,     57686991.000,            1.430],
       [           1.850,          623.000,      3002631.960,      2899484.080,            0.640],
       [          13.760,         1227.000,   1737874137.500,   1446511574.320,            4.320],
       [          13.760,         1227.000,   1737874137.500,   1446511574.320,            4.320]])

Exemple complet Démo 2 :

import numpy as np  
#chaotic python list of lists with very different numeric magnitudes 

#            very tiny      medium size            large sized
#            numbers        numbers                numbers

my_list = [[0.000000000074, 5162, 13683628846.64, 1.01e10, 1.81], 
           [1.000000000055,  116, 189688622.37, 260332262.0, 1.97], 
           [0.010000000022,  768, 6004865.13,   -99e13, 1.21], 
           [1.000000000074, 4062, 3263822121.39, 3066869087.9, 1.93], 
           [2.91,            474, 44555062.72, 44555062.72, 0.41], 
           [5,              5006, 8254968918.1, 7446788272.74, 3.25], 
           [0.01,           7887, 30078971595.46, 27814989471.31, 2.18], 
           [7.03,            116, 66252511.46, 81109291.0, 1.56], 
           [6.52,            116, 47674230.76, 57686991.0, 1.43], 
           [1.85,            623, 3002631.96, 2899484.08, 0.64], 
           [13.76,          1227, 1737874137.5, 1446511574.32, 4.32], 
           [13.76,          1337, 1737874137.5, 1446511574.32, 4.32]] 
import sys 
#convert python list of lists to numpy ndarray called my_array 
my_array = np.array(my_list) 
#following two lines do the same thing, showing that np.savetxt can 
#correctly handle python lists of lists and numpy 2D ndarrays. 
np.savetxt(sys.stdout, my_list, '%19.2f') 
np.savetxt(sys.stdout, my_array, '%19.2f') 

Imprimés :

 0.00             5162.00      13683628846.64      10100000000.00              1.81
 1.00              116.00        189688622.37        260332262.00              1.97
 0.01              768.00          6004865.13 -990000000000000.00              1.21
 1.00             4062.00       3263822121.39       3066869087.90              1.93
 2.91              474.00         44555062.72         44555062.72              0.41
 5.00             5006.00       8254968918.10       7446788272.74              3.25
 0.01             7887.00      30078971595.46      27814989471.31              2.18
 7.03              116.00         66252511.46         81109291.00              1.56
 6.52              116.00         47674230.76         57686991.00              1.43
 1.85              623.00          3002631.96          2899484.08              0.64
13.76             1227.00       1737874137.50       1446511574.32              4.32
13.76             1337.00       1737874137.50       1446511574.32              4.32
 0.00             5162.00      13683628846.64      10100000000.00              1.81
 1.00              116.00        189688622.37        260332262.00              1.97
 0.01              768.00          6004865.13 -990000000000000.00              1.21
 1.00             4062.00       3263822121.39       3066869087.90              1.93
 2.91              474.00         44555062.72         44555062.72              0.41
 5.00             5006.00       8254968918.10       7446788272.74              3.25
 0.01             7887.00      30078971595.46      27814989471.31              2.18
 7.03              116.00         66252511.46         81109291.00              1.56
 6.52              116.00         47674230.76         57686991.00              1.43
 1.85              623.00          3002631.96          2899484.08              0.64
13.76             1227.00       1737874137.50       1446511574.32              4.32
13.76             1337.00       1737874137.50       1446511574.32              4.32

Notez que l'arrondi est cohérent avec une précision de 2 unités, et que la notation exponentielle est supprimée à la fois dans les très grandes valeurs et dans les très petites valeurs. e+x et très petit e-x des gammes.

Answer 3

Pour les tableaux 1D et 2D, vous pouvez utiliser np.savetxt pour imprimer en utilisant une chaîne de format spécifique :

>>> import sys
>>> x = numpy.arange(20).reshape((4,5))
>>> numpy.savetxt(sys.stdout, x, '%5.2f')
 0.00  1.00  2.00  3.00  4.00
 5.00  6.00  7.00  8.00  9.00
10.00 11.00 12.00 13.00 14.00
15.00 16.00 17.00 18.00 19.00

Vos options avec numpy.set_printoptions ou numpy.array2string dans la v1.3 sont plutôt maladroites et limitées (par exemple aucun moyen de supprimer la notation scientifique pour les grands nombres). Il semble que cela va changer avec les futures versions, avec numpy.set_printoptions(formatter=..) et numpy.array2string(style=..).

Answer 4

Vous pourriez écrire une fonction qui convertit une notation scientifique en notation régulière, quelque chose comme

def sc2std(x):
    s = str(x)
    if 'e' in s:
        num,ex = s.split('e')
        if '-' in num:
            negprefix = '-'
        else:
            negprefix = ''
        num = num.replace('-','')
        if '.' in num:
            dotlocation = num.index('.')
        else:
            dotlocation = len(num)
        newdotlocation = dotlocation + int(ex)
        num = num.replace('.','')
        if (newdotlocation < 1):
            return negprefix+'0.'+'0'*(-newdotlocation)+num
        if (newdotlocation > len(num)):
            return negprefix+ num + '0'*(newdotlocation - len(num))+'.0'
        return negprefix + num[:newdotlocation] + '.' + num[newdotlocation:]
    else:
        return s