Dans mon expérience avec graphviz pour le rendu des graphiques de cette taille (~ 700 nœuds), un minimum d'essais et d'erreurs d'ajustement à cette combinaison de paramètres d'attributs--structurel, certains purement esthétique, pour tous les trois objets (graphe, les nœuds et les arêtes) devrait faire ce que vous voulez:
réduire la distance minimale de séparation entre les nœuds, via nodesep'; par exemple, les nœuds[nodesep=0.75]; cela rendra votre graphique "trop compact." (nodesep et ranksep probablement affecter la façon dot dessine un graphique plus que tout autre paramètre réglable)
réduire la distance minimale entre les nœuds de rang différent, les e.g, des nœuds[ranksep=0.75]; 'ranksep' définit la distance minimale entre les nœuds de rang différent--cela va affecter votre présentation graphique de manière significative si votre graphique est composé de plusieurs rangs
augmentation de l'arête de poids, par exemple, le segment [=poids de 1,2]; cela permettra de rendre les bords plus courts, à son tour rendre le graphique plus compact
supprimer le nœud frontières et le nœud de remplissage, par exemple, les nœuds[color=aucun; la forme=plaintext], en particulier pour l'ovale en forme de nœuds, une fraction substantielle du total nœud de l'espace est "inutilisé" (c'est à dire pas utilisé pour afficher l'étiquette du nœud); chaque nœud de l'empreinte est maintenant réduit à son texte
définir explicitement la taille de la police pour les nœuds (nœud frontières sont agrandies afin qu'ils entourent le nœud de texte, ce qui signifie que la taille de la police et de la quantité de texte pour un noeud donné a un effet significatif sur sa taille); [fontsize=11] doit être suffisamment grand pour être lisible, mais aussi de réduire les encombré de l'apparence (la taille par défaut est de 14)
utiliser des couleurs différentes pour les nœuds et les arêtes--cela rendra votre graphique plus facile à lire; par exemple, définir le nœud 'texte' fontcolor bleu et le bord fontcolor "gris" à l'aide de l'œil à distinguer les deux ensembles de graphe structures. Cela permettra de faire une plus grande différence que vous ne le pensez.
définir explicitement total graphique de la taille, par exemple, le graphique[size="7.75,10.25"] (veille à ce que votre graphique s'adapte sur une page 8,5 x 11 et qu'il occupe tout l'espace)