Syntaxe correcte pour mutate_if

Question

Je voudrais remplacer les valeurs NA par des zéros via mutate_if dans dplyr. La syntaxe ci-dessous :

set.seed(1)
mtcars[sample(1:dim(mtcars)[1], 5),
       sample(1:dim(mtcars)[2], 5)] <-  NA

require(dplyr)

mtcars %>% 
    mutate_if(is.na,0)

mtcars %>% 
    mutate_if(is.na, funs(. = 0))

Renvoie une erreur :

Erreur dans vapply(tbl, p, logical(1), ...) : les valeurs doivent être de longueur 1, mais le résultat de FUN(X[[1]]) est de longueur 32

Quelle est la syntaxe correcte pour cette opération ?

Answer 1

Le "if" dans mutate_if se réfère au choix des colonnes, pas des lignes. Par exemple mutate_if(data, is.numeric, ...) signifie effectuer une transformation sur toutes les colonnes numériques de votre jeu de données.

Si vous voulez remplacer tous les NA par des zéros dans les colonnes numériques :

data %>% mutate_if(is.numeric, funs(ifelse(is.na(.), 0, .)))

Answer 2

J'ai appris ce tour du tutoriel purrr, et cela fonctionne aussi dans dplyr. Il existe deux façons de résoudre ce problème :
Tout d'abord, définissez des fonctions personnalisées en dehors du pipe, et utilisez-les dans mutate_if():

any_column_NA <- function(x){
    any(is.na(x))
}
replace_NA_0 <- function(x){
    if_else(is.na(x),0,x)
}
mtcars %>% mutate_if(any_column_NA,replace_NA_0)

Deuxièmement, utilisez la combinaison de ~, . ou .x. ( .x peut être remplacé par ., mais pas par tout autre caractère ou symbole):

mtcars %>% mutate_if(~ any(is.na(.x)),~ if_else(is.na(.x),0,.x))
#Cela fonctionne aussi
mtcars %>% mutate_if(~ any(is.na(.)),~ if_else(is.na(.),0,.))

Dans votre cas, vous pouvez également utiliser mutate_all():

mtcars %>% mutate_all(~ if_else(is.na(.x),0,.x))

En utilisant ~, nous pouvons définir une fonction anonyme, tandis que .x ou . représente la variable. Dans le cas de mutate_if(), . ou .x est chaque colonne.

Answer 3

mtcars %>% mutate_if(is.numeric, replace_na, 0)

ou syntaxe plus récente

mtcars %>% mutate(across(where(is.numeric),
                         replace_na, 0))

Answer 4

Nous pouvons utiliser set de data.table

library(data.table)
setDT(mtcars)
for(j in seq_along(mtcars)){
  set(mtcars, i= which(is.na(mtcars[[j]])), j = j, value = 0)
 }

Answer 5

Je lutte toujours avec la fonction replace_na de dplyr

  remplacer(is.na(.),0)

cela fonctionne pour moi pour ce que vous essayez de faire.